Почему мы умираем: Передовая наука о старении и поиск бессмертия - Венки Рамакришнан

J. Luncsford, and M. Armanios, "Long Telomeres and Cancer Risk: The Price of Cellular Immortality," Journal of Clinical Investigation 129, no. 9 (August 5, 2019): 3474–81, https://doi.org/10.1172/JCI120851.

129

Официальный текст заявления Белого дома и правительства Великобритании по поводу публикации первоначальной расшифровки человеческого генома см. на сайте Национального института генома человека, новость от 26 июня 2000 г.: "June 2000 White House Event," https://www.genome.gov/10001356/june-2000-white-house-event. Несколько иная версия заявления вышла в The New York Times: "Text of the White House Statements on the Human Genome Project," Science, The New York Times online, June 27, 2000, https://archive.nytimes.com/www.nytimes.com/library/national/science/062700sci-genome-text.html. Сама последовательность ДНК описана в двух объемных публикациях: результаты работы международного консорциума в статье: "Initial Sequencing and Analysis of the Human Genome," Nature 409, no. 6822 (February 15, 2001): 860–921, https://doi.org/10.1038/35057062, результаты работы Celera Corporation в статье: J. C. Venter et al., "The Sequence of the Human Genome," Science 291, 1304–51, https://doi.org/10.1126/science.1058040.

130

Цит. по: G. Yamey, "Scientists Unveil First Draft of Human Genome," BMJ 321, no. 7252 (July 1, 2000): 7, https://doi.org/10.1136/bmj.321.7252.7.

131

"Profile: Craig Venter," BBC News online, дата последнего изменения 21.05.2010, https://www.bbc.co.uk/news/10138849.

132

"US Patent Application Stirs Up Gene Hunters," Nature 353 (October 10, 1991): 485–86 (1991), https://doi.org/10.1038/353485a0; N. D. Zinder, "Patenting cDNA 1993: Efforts and Happenings" (abstract), Gene 135, nos. 1/2 (December 1993): 295–98, https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/037811199390080M.

133

Matthew Herper, "Craig Venter Mapped the Genome. Now He's Trying to Decode Death," Forbes (online), February 21, 2017, https://www.forbes.com/sites/matthewherper/2017/02/21/can-craig-venter-cheat-death/?sh=8f6fefa16456.

134

John Sulston and Georgina Ferry, The Common Thread: A Story of Science, Politics, Ethics, and the Human Genome (New York: Random House, 2002).

135

"How Diplomacy Helped to End the Race to Sequence the Human Genome," Nature 582, no. 7813 (June 2020): 460, https://doi.org/10.1038/d41586–020–01849-w.

136

S. Reardon, "A Complete Human Genome Sequence Is Close: How Scientists Filled in the Gaps," Nature 594, no. 7862 (June 2021): 158–59, https://doi.org/10.1038/d41586–021–01506-w.

137

Прекрасный популярный обзор по эпигенетике дан в книге Нессы Кэри: Nessa Carey, The Epigenetics Revolution: How Modern Biology Is Rewriting Our Understanding of Genetics, Disease, and Inheritance (New York: Columbia University Press, 2012). Книга Мухерджи (Mukherjee, The Gene) посвящена в большей степени природе гена, но уделяет много внимания и эпигенетике.

138

R. Briggs and T. J. King, "Transplantation of Living Nuclei from Blastula Cells into Enucleated Frogs' Eggs," Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) of the United States of America 38, no. 5 (May 1952): 455–63, https://doi.org/10.1073/pnas.38.5.455.

139

"Sir John B. Gurdon: Biographical," Nobel Prize online, по сост. на 7 августа 2023 г., https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2012/gurdon/biographical/.

140

J. B. Gurdon and N. Hopwood, "The Introduction of Xenopus Laevis into Developmental Biology: Of Empire, Pregnancy Testing and Ribosomal Genes," International Journal of Developmental Biology 44, no. 1 (2000): 43–50.

141

J. B. Gurdon, "The Developmental Capacity of Nuclei Taken from Intestinal Epithelium Cells of Feeding Tadpoles," Development 10, no. 4 (December 1, 1962): 622–40, https://doi.org/10.1242/dev.10.4.622.

142

I. Wilmut et al., "Viable Offspring Derived from Fetal and Adult Mammalian Cells," Nature 385, no. 6619 (February 27, 1997): 810–13, https://doi.org/10.1038/385810a0.

143

M. J. Evans and M. H. Kaufman, "Establishment in Culture of Pluripotential Cells from Mouse Embryos," Nature 292, no. 5819 (July 9, 1981): 154–56, https://doi.org/10.1038/292154a0; G. R. Martin, "Isolation of a Pluripotent Cell Line from Early Mouse Embryos Cultured in Medium Conditioned by Teratocarcinoma Stem Cells," Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS) of the United States of America 78, no. 12 (December 1, 1981): 7634–38, https://doi.org/10.1073/pnas.78.12.7634.

144

Shinya Yamanaka, "Shinya Yamanaka: Biographical," Nobel Prize online, https://www.nobelprize.org/prizes/medicine/2012/yamanaka/biographical/.

145

Система лактозных оператора и репрессора была открыта в 1960-е гг. Жаком Моно и Франсуа Жакобом; это открытие вместе с открытием другого генетического переключателя в бактериофагах, который обнаружил Андре Львов, было удостоено в 1965 г. Нобелевской премии. Подробный рассказ об этом см.: M. Lewis, "A Tale of Two Repressors," Journal of Molecular Biology 409, no. 1 (May 27, 2011): 14–27, https://doi.org/10.1016/j.jmb.2011.02.023.

146

Британский генетик Эдриен Берд доказал, что метилирование происходит главным образом на островках с CpG повторами. Поскольку C (цитозин) сочетается с G (гканином), если имеется CpG-островок, то C и G в одной цепи окажутся прямо напротив G и C в другой. Каждый C окажется напротив по диагонали от C в другой цепи. В процессе метилирования CpG-островка клетка метилирует C в обеих цепях. После деления клетки мы получаем две молекулы ДНК вместо одной. В каждой из них есть исходная цепь, в которой С метилирован, и вновь образованная цепь, где метилирования нет. Существуют особые ферменты метилтрансферазы, которые добавляют к основанию С метильную группу только в том случае, если С, расположенный по диагонали в другой цепи, уже метилирован. Это гарантирует, что обе цепи в спирали ДНК будут метилированы точно в тех же местах, где и были раньше, до деления клетки.

147

E. W. Tobi et al., "DNA Methylation as a Mediator of the Association Between Prenatal Adversity and Risk Factors for Metabolic Disease in Adulthood," Science Advances 4, no. 1 (January 31, 2018): eaao4364, https://doi.org/10.1126/sciadv.aao4364; Carl Zimmer, "The Famine Ended 70 Years Ago, But Dutch Genes Still Bear Scars," The New York Times online, January 31, 2018, https://www.nytimes.com/2018/01/31/science/dutch-famine-genes.html. See also Mukherjee, The Gene, and Carey, The epigenetics Revolution.

148

Популярный рассказ о Стиве Хорвате и эпигенетических часах с точки зрения специалиста см.: Ingrid Wickelgren, "Epigenetic 'Clocks' Predict Animals' True Biological Age," Quanta, last modified August 17, 2022, https://www.quantamagazine.org/epigenetic-clocks-predict-animals-true-biological-age-20220817/. Некоторые приведенные в моей книге данные о Хорвате взяты из этой статьи.

149

M. E. Levine et al., "An Epigenetic Biomarker of Aging for Lifespan and Healthspan," Aging 10, no. 4 (April 2018): 573–91, https://doi.org/10.18632/aging.101414.

150

S. Horvath and K. Raj, "DNA Methylation-Based Biomarkers and the Epigenetic Clock Theory of Ageing," Nature Reviews Genetics 19, no. 6 (June 2018): 371–84, https://doi.org/10.1038/s41576–018–0004–3.

151

Пример см.: G. Hannum et al., "Genome-wide Methylation Profiles Reveal Quantitative Views of Human Aging Rates," Molecular Cell 49, no. 2 (January 24, 2013): 359–67, https://doi.org/10.1016/j.molcel.2012.10.016.

152

C. Kerepesi et al., "Epigenetic Clocks Reveal a Rejuvenation Event During Embryogenesis Followed by Aging," Science Advances 7, no. 26 (June 25, 2021): eabg6082, https://doi.org/10.1126/sciadv.abg6082; C. Kerepesi et al., "Epigenetic Aging of the Demographically Non-Aging Naked Mole-Rat," Nature Communications 13, no. 1 (January 17, 2022): 355, https://doi.org/10.1038/s41467–022–27959–9.

153

R. Kucharski