Вселенная внутри нас. Как микробы обогащают наш взгляд на жизнь - Эд Йонг

(Sonnenburg et al., 2016), и описали преимущества клетчатки (Sonnenburg, Sonnenburg, 2014).

209

Микробиому жителей сельских районов посвящено несколько исследований, в том числе передовые статьи Карлотты де Филиппо и Тани Яцуненко (De Filippo et al., 2010; Yatsunenko et al., 2012).

210

American Chemical Society, 1999.

211

О влиянии антибиотиков на микробиом: Cox, Blaser, 2014; там же указаны приблизительные детские дозы антибиотиков. Другие исследования, в которых показано, какое воздействие антибиотики оказывают на микробиом: Dethlefsen, Relman, 2011; Dethlefsen et al., 2008; Jakobbson et al., 2010; Jernberg et al., 2010; Schubert et al., 2015.

212

Это выяснилось в 1960-х, когда ученые доказали, что мышиные фекалии могли остановить размножение сальмонеллы, но лишь в тех случаях, когда мышей предварительно не кормили антибиотиками (Bohnhoff et al., 1964).

213

Это сравнение придумала Кэтрин Лемон (Lemon et al., 2012).

214

Первое исследование связи антибиотиков с ожирением Блейзер проводил со своим коллегой Илсуном Чо (Cho et al., 2012). Вторым руководила Лора Кокс (Cox et al., 2014). Эпидемиологическое исследование возглавил Леонардо Трасанде (Trasande et al., 2013).

215

Так он написал у себя в «Твиттере». Маршалл – ученый, доказавший, что H. pyloriвызывает гастрит, очень интересным способом: он сам эту бактерию съел.

216

Всем интересующимся этой темой просто необходимо прочесть рассказ Мэрин Маккенны о постантибиотической эре (McKenna, 2013) и ее книгу Superbug (McKenna, 2010).

217

Rosebury, 1969, с. 11.

218

Исследования H. pylori: Blaser, 2005. Опасения насчет ее исчезновения: Blaser, 2010; Blaser, Falkow, 2009. О долгой совместной истории H. pylori и человека: Linz et al., 2007. Авторская заметка в журнале The Lancet: Graham, 1997. Об отсутствии влияния H. pyloriна смертность в целом: Chen et al., 2013.

219

Исследованием руководил Зак Льюис.

220

В англоязычных психологических и социологических исследованиях употребляется акроним WEIRD (Western, Educated, Industrialised, Rich, Democratic) – то есть «странные» страны. – Прим. ред.

221

Исследования микробиомов жителей поселений и аборигенов, промышляющих охотой и собирательством: Clemente et al., 2015; Gomez et al., 2015; Martinez et al., 2015; Obregon-Tito et al., 2015; Schnorr et al., 2014. Исследование, посвященное микробам в копролитах: Tito et al., 2012.

222

Le Chatelier et al., 2013.

223

У жителей Камеруна, пораженных паразитической амебой Entamoeba, кишечный микробиом куда более разнообразен, а если у них еще и глисты имеются, то тем более. Может, бактерии дают паразитам доступ к организму, а может, паразиты каким-то образом увеличивают количество видов бактерий. Как бы там ни было, в этом случае разнообразие кишечных микробов, которым обладают селяне, указывает на присутствие чего-то нежелательного в организме (Gomez et al., 2015).

224

Moeller et al., 2014.

225

Blaser, 2014, с. 6.

226

Eisen, 2014.

227

Mukherjee, 2011, сс. 349–356.

228

Уже написано столько научных статей, связывающих кишечный микробиом с тем или иным заболеванием, что Элизабет Бик, неустанный летописец новых исследований в области микробиома, придумала шуточный тег в «Твиттере» – #gutmicrobiomeandrandomthing («кишечный микробиом и все что угодно»). Среди постов можно найти «Кишечный микробиом и почему я все время встаю в самую медленную очередь», «Кишечный микробиом и искусство ремонта мотоциклов» и «Кишечный микробиом и узник Азкабана».

229

The Allium, 2014.

230

Что касается дисбиоза, Фергус Шэнахан предупреждает, что «нельзя забывать о словах Джорджа Оруэлла: «наша собственная неаккуратность в выборе слов заставляет нас мыслить на не столь высоком уровне». Врачи порой ошибаются из-за неточностей в номенклатуре и терминологии. Неологизмы следует включать в речь с осторожностью – зачастую они не нужны или же подразумевают понимание там, где его нет» (Shanahan, Quigley, 2014).

231

Этот аргумент я привел в статье о контекстуальной природе микробиома в The New York Times (Yong, 2014c).

232

Данным исследованием руководили Рут Лей и Омри Корен (Koren et al., 2012).

233

Исследованиями микробиома влагалища руководили Ларри Форни и Жак Равель (Gajer et al., 2012; Ma et al., 2012). Анализ других частей тела провел Пэт Шлосс (Ding, Schloss, 2014).

234

Одним исследованием руководила Кэтрин Поллард, а другим – Роб Найт (Finucane et al., 2014; Walters et al., 2014).

235

Сюзанна Сэлтер и Алан Уокер доказали, что на инструментах для извлечения ДНК из образцов и ее подготовки к секвенированию практически всегда в небольшом количестве присутствует ДНК микробов (Salter et al., 2014).

236

Пэт Шлосс, например, написал программу, которая предсказывает по образцу микробиома, в какой степени он подвержен колонизации C-diff (Schubert et al., 2015).

237

Некоторые ученые пытались ответить на этот вопрос, наблюдая за собственными микробиомами. Эрик Альм и Лоуренс Дэвид из Массачусетского технологического института занимались этим ежедневно на протяжении года. Дэвид, подхватив так называемую диарею путешественника в Бангкоке, получил возможность проследить, как сообщество его кишечных микробов пережило переворот и со временем вернулось в нормальное состояние. Альм, подцепив сальмонеллу после неудачного похода в ресторан, заметил, как быстро эта зараза захватила весь его кишечник и как сообщество микробов переключилось в совершенно другое состояние, когда он выздоровел (David et al., 2014).

238

Subramanian et al., 2014.

239

Вместе с Плэнером этим исследованием руководил Эндрю Кау (Kau et al., 2015).

240

Chowbacca, от англ. chow – корм. – Прим. ред.

241

Redford et al., 2012.

242

История Фрица: University of Utah, 2012. Первоначальное описание HS: Clayton et