Вселенная внутри нас. Как микробы обогащают наш взгляд на жизнь - Эд Йонг

утверждает он. – Вряд ли искусственные смеси окажутся лучше, ведь лучше уж некуда». Если бы ему самому вдруг понадобилась пересадка, он предпочел бы провести ее старым, проверенным способом.

387

Haiser et al., 2013.

388

Carmody, Turnbaugh, 2014; Clayton et al., 2009; Vétizou et al., 2015.

389

Dobson et al., 2015; Smith et al., 2015.

390

Haiser, Turnbaugh, 2012; Holmes et al., 2012; Lemon et al., 2012; Sonnenburg, Fischbach, 2011.

391

Исследование ТМАО: Tang, Hazen, 2014; обнаружение вещества, из-за которого бактерии перестают вырабатывать ТМАО: Wang et al., 2015.

392

О таких пробиотиках я писал в New Scientist (Yong, 2015c).

393

Kotula et al., 2014.

394

Исследование кишечной палочки, проведенное Чаном: Saeidi et al., 2011. Джим Коллинз стал одним из основателей стартапа под названием Synlogic, нацеленного на массовое производство таких микробов. Он уверен, что первые клинические исследования начнутся уже через пару лет.

395

Rutherford, 2013.

396

Claesen, Fischbach, 2015; Sonnenburg, Fischbach, 2015.

397

Кишечник успешно заселяют дикие штаммы кишечной палочки – например, в первые часы жизни новорожденного. Однако культивируемые штаммы E. coli, хорошо адаптированные к лабораторным условиям, способность колонизировать кишечник утратили. – Прим. ред.

398

Первую статью об изменении генома B-theta написал Тимоти Лу (Mimee et al., 2015). Группа Зонненберга от него почти не отстает.

399

Olle, 2013.

400

Iturbe-Ormaetxe et al., 2011; LePage, Bordenstein, 2013.

401

Изначально его идея состояла в том, чтобы модифицировать геном вольбахии, добавив в него гены, ответственные за производство антител для вируса денге. Если бы у него получилось, бактерия, как у нее принято, вскоре распространилась бы по всей популяции вместе с антителами. Однако модифицировать вольбахию оказалось нелегко. О’Нилл решил оставить эту затею спустя шесть лет. Никому так до сих пор и не удалось это сделать.

402

Первое упоминание штамма «попкорн»: Min, Benzer, 1997; Конору Макмениману удается успешно ввести вольбахию в комариные яйца: McMeniman et al., 2009.

403

Моделирование проводил Майкл Турелли в Калифорнийском университете в Дейвисе (Bull, Turelli, 2013), а затем результаты подтвердились и во время полевых испытаний. Когда исследователи выпустили комаров с «попкорном» на небольшом вьетнамском островке, надолго там не задержались ни комары, ни их симбионты.

404

Кэрин Джонсон и Луи Тексера обнаружили, что вольбахия дает мушкам устойчивость к вирусам: Hedges et al., 2008; Teixeira et al., 2008; группой О’Нилла показано, что и к комарам это тоже относится: Moreira et al., 2009.

405

Том Уокер занимался введением wMel в яйца Aedes, а Эри Хоффманн и Скотт Ричи вместе с О’Ниллом проводили испытания в вольерах (Walker et al., 2011).

406

О’Нилл знал, что ждет ученых, решивших не принимать в расчет местных жителей. В 1969 году представители Всемирной организации здравоохранения отправились в Индию, чтобы испытать новые технологии контроля популяций комаров, в том числе генную инженерию, облучение и вольбахию (Nature, 1975). Проект решили скрывать от местных жителей, и те заподозрили неладное. Журналисты принялись обвинять ученых, некоторые из которых были американцами, в том, что Индия для них – лишь испытательный полигон для экспериментов, которые в Америке проводить побоялись, и даже в том, что они занимаются разработкой биологического оружия. Ученые отреагировали просто – они вообще никак не стали реагировать. «Получился какой-то кошмар в плане публичного освещения, – рассказывает О’Нилл. – Их выгнали из страны, а из-за возникших разногласий на двадцать лет запретили генетически модифицировать комаров». О’Нилл хотел избежать их ошибок.

407

Hoffmann et al., 2011.

408

Проекты организации «Ликвидируем денге»: www.eliminatedengue.com; о проекте в городе Таунсвилле мне рассказали О’Нилл и Кейт Ретцки, о проектах в Индонезии и Колумбии – Бекти Андари и Ана Кристина Патино Таборда.

409

Chrostek et al., 2013; McGraw, O’Neill, 2013.

410

Введение вольбахии комарам Anopheles: Bian et al., 2013; сокращение численности других насекомых-вредителей с помощью вольбахии: Doudoumis et al., 2013; некоторые бактерии в кишечном тракте комаров также умеют блокировать плазмодии, их можно давать насекомым в качестве пробиотика для борьбы с малярией: Hughes et al., 2014.

411

Микробное облако вокруг нас: Meadow et al., 2015; примерные подсчеты бактерий в этом облаке: Qian et al., 2012.

412

Lax et al., 2014.

413

Подмышечные (аксиллярные) области, если вам вдруг интересно.

414

Van Bonn et al., 2015.

415

Проект «Микробиом больницы»: Westwood et al., 2014; о микробах в больнице и вероятности заражения: Lax, Gilbert, 2015; результаты проекта: Lax et al., 2017.

416

Результаты уже есть (Lax et al., 2017). Как выяснилось, в первый день пребывания пациента в больнице микробы в основном перебираются со спинок кроватей, ручек кранов и других поверхностей на его кожу, а начиная со второго дня перемещаются в обратном направлении – то есть собственные микробы пациента обживают больничную палату. В итоге микробиом помещения начинает напоминать кожный микробиом пациента. Кроме того, исследователи узнали, что чаще медперсонал является источником бактерий для пациентов, чем наоборот, а на больничных поверхностях обитает намного больше устойчивых к антибиотикам микробов, чем на коже пациентов. – Прим. ред.

417

Gibbons et al., 2015.

418

Исследования Джессики Грин, посвященные окнам в больнице: Kembel et al., 2012; записи Флоренс Найтингейл: Nightingale, 1859.

419

Микробиом помещений: Adams et al., 2015; исследование Грин в «Лиллис-холле»: Kembel et al., 2014; выступление TED и обзор по теме биоинформированного