Кошки, гены и эволюция - Павел Михайлович Бородин

2. Котята, конечно, мимимишные, но и их лучше оставить для социальных сетей. На детской шерсти многие гены окраски проявляются нечетко.

3. Если вам попадется на глаза кошачья семья, включайте в анализ только одного из представителей этой семьи, выбранного наугад.

4. Не забудьте включить на своем телефоне регистрацию местоположения фотографий. Это вам потом пригодится для геногеографического анализа.

К анализу данных можно приступать уже после первой фотографии, а можно подождать, пока их накопится приличное число. Что считать приличным числом для науки – не такой простой вопрос, как кажется. Чтобы на него ответить, нам пришлось бы уйти в дебри математической статистики и теории вероятностей. Но мы опасаемся, что, пока мы будем водить вас по этим дебрям, половина из вас разбежится и забросит эту книжку в кусты.

Поэтому мы просто скажем вам минимально приличное число для популяционных работ – 100 кошек на популяцию. Но, конечно, чем больше, тем лучше. Рекордную выборку собрал немецкий коллега Павла Бородина. Она насчитывала 10 392 образца164. Но там был очень специфический подход. Этот коллега получил доступ к залежам кошачьих мехов на пушно-меховой базе в городе Лейпциге аккурат перед ее закрытием навеки. Туда они попадали от санитарных служб Германской Демократический Республики, которые занимались истреблением уличных котов. Эти шкурки использовались в скорняжной промышленности. Сейчас этот бизнес в ЕС под полным запретом. Как обстоят дела у нас – мы не знаем. Настораживает то, что ГОСТ на кошачий мех действует до сих пор[67]. Но нет, не нужны нам данные, собранные таким образом. Не говоря уж о том, что сам метод негуманный, он еще и научно бесполезный, потому что этот материал лишен главного – географической привязки. Поэтому мы игнорируем пушномеховые базы и идем в поле.

Как только закончите полевые работы (фотографирование котов), приступайте к камеральным – определению их фенотипов и составлению научных таблиц.

Нет, все наоборот. Начнем с составления таблиц.

Мы рекомендуем вам таблицу 10–1. Смысл первых трех колонок понятен. Номер фото важен, на случай если вам понадобится проверить правильность определения генотипа. Координаты вам будут нужны для привязки ваших наблюдений к карте мира или вашего города. Они легко извлекаются из метаданных снимка. Дата есть дата. Мало ли для чего может понадобиться. И вообще, это у вас лабораторный журнал, а в лабораторном журнале дата обязана быть при каждой записи. Так положено. Дальше идут колонки для генотипов, которые вам предстоит диагностировать. Уверенные диагнозы мы будем обозначать галочками – “v”, неуверенные – знаками вопроса – “?”. По галочкам потом будет удобно фильтровать данные в колонках и подсчитывать число и долю генотипов по каждому гену отдельно и с учетом эпистаза.

Табл. 10–1. Образец бланка для учета аллелей окраски у кошек.

Теперь представим, что перед нами живые коты или их фотографии, и потренируемся в определении их генотипов.

Начинаем с длины шерсти. Длинношерстные коты – это гомозиготы l/l. Короткошерстные, или стандартные коты, – это либо гомозиготы L/L, либо гетерозиготы L/l. Вопрос о том, как отличить длинношерстного кота от короткошерстного, – не такая простая задача, как кажется на первый взгляд. Наш совет – ориентируйтесь на хвост. Если он пушистый – значит, кот длинношерстный. Ставим крестик в колонке l/l (ряд IMG–1). Если короткошерстный – оставляем эту клетку пустой, как показано для остальных рядов в нашей таблице.

Но еще раз – игнорируйте породистых котов. Если вам попадется длинношерстный кот с носом, приплюснутым по самое не могу, гордо пройдите мимо. Это дорогой и породистый персидский кот. Высока вероятность, что он при этом совершенно белый (W/W или W/w). Тем более игнорируйте. На самом деле последователи Серла почти всегда включали в популяционный анализ белых котов. И зря. Частота их во всех популяциях близка к нулю и обусловлена, как правило, случайными встречами с породистыми котами. Так что вы можете учитывать белых, но мы бы этого не делали. Сиамских (cs) и бурманских (cb) мы бы тоже игнорировали. Скорее всего, это породистые, выпущенные на прогулку, или потеряшки. Популяционной погоды они не делают.

А вот на пегих котов (WS/_) стоит обратить пристальное внимание. Здесь все тоже не просто. Несведущие люди часто принимают за пегость осветленную манишку у котов с окраской агути и рыжих котов. Эта манишка – нормальная особенность таких котов и не имеет отношения к наличию мутантных аллелей WS. Что отличает носителей WS от нормальных котов – это четкие границы между белыми и небелыми участками тела.

Как вы помните, размер пегости может варьировать от белых носочков до почти полностью белой окраски с небольшими участками окрашенного меха на голове. Вы также помните, что, глядя на размер пегости, невозможно отличить гомозиготы WS/WS от гетерозигот WS/w. Поэтому всех пегих котов регистрируем как WS/_ и ставим метку в соответствующей колонке. Мы забыли вам сказать, что у длинношерстного кота с IMG–1 было большое белое пятно на лапах, животе и боках. Теперь вспомнили и поставили ему галочку в колонке WS/_.

Обратите внимание, что все остальные колонки ряда IMG–1 мы оставили пустыми. Почему? Потому что ни одного из мутантных генотипов, обозначенных в этих колонках, у этого кота не выявили. Он не был ни рыжим, ни черепаховым, ни черным, ни мраморным, а имел нормальную полосатую агути-окраску.

На IMG–2 у нас изображена замечательная кошка, которая отмечена носительством сразу четырех мутантных аллелей. У нее белые пятна на боках и хвосте, поэтому обозначаем ее WS/_. Но кроме того, она черепаховая, то есть имеет на шкурке пятна рыжего (О/o) и черного (а/а) цветов. Более того, на ее рыжих участках мы видим не полосатый тэбби, а мраморный (tab/tab). На черном мы, как вы помните, никакого тэбби увидеть не можем, а на рыжем можем и поэтому с полным правом ставим метки в колонках WS/_, O/o, a/a и tab/tab.

Кстати, будьте бдительны и не принимайте нормальную агути-кошку, у которой шерсть порыжела от солнца, за черепаховую. Такие рыжие пятна от солнечного выгорания черного пигмента иногда видны и на черных (не-агути) кошках. Секрет здесь, как и в случае с белыми пятнами, – обращайте внимание на резкость границы между рыжими и нерыжими участками. У черепаховых кошек они резкие, а у выгоревших – размытые.

Считаем своим долгом предупредить вас, что различение мраморного tab/tab и полосатых Ta/_ окрасов – довольно сложная задача даже для опытных наблюдателей. Нам удалось различить мраморный окрас на рыжих пятнах у кошки